La moisissure est essentiellement due à la croissance et à la prolifération de bactéries. Les bouteilles en papier doivent subir un traitement de stérilisation à haute température, supérieur à 150 °C, lors du pressage humide, afin d'éviter l'apparition de moisissures pendant un certain temps. Cette durée dépend de la composition du contenu et du degré d'étanchéité.